Podezření a spekulace
Vyšetřovatelé systematicky prověřovali několik hlavních teorií o Patrickově zmizení. Prvotní podezření padlo na jeho biologickou matku Jennifer Rodriguez, která byla zadržena týden po zmizení poté, co rodinný soudce usoudil, že ví víc, než přiznává. Jennifer byla podrobena několikahodinovému výslechu a detektoru lži. Test prošla v otázce, zda neví, kde se Patrick nachází, ale údajně neprošla, když byla tázána na svou znalost okolností jeho zmizení. Přesto byla nakonec z vyšetřování vyloučena a propuštěna po několika dnech ve vazbě.
Pěstounka Librada Moranová byla vyloučena z podezření velmi rychle. Poručík Zimmerman uvedl: "Měl jsem z ní dobré pocity. Dům byl bezvadný. Její minulost jako pěstounky byla neuvěřitelná, nikdy žádná stížnost. Měla dobré úmysly a byla viditelně rozrušená." Přesto vyšetřovatelé nikdy zcela nevyloučili možnost, že někdo z širší rodiny nebo okolí mohl být do zmizení Patricka zapojen.
Kromě teorie, že Patrick skutečně utekl s úmyslem dostat se zpět ke své matce na Staten Island, se řešily i další scénáře. Alternativní zahrnoval únos neznámou osobou, která využila příležitosti nalezení malého chlapce samotného v chodbě domu. Soukromý detektiv dokonce obdržel tip, že byl Patrick unesen a odvezen do Portorika, ale tato stopa nebyla nikdy potvrzena.