Svůj rodný dům a přilehlé prostory Náprstek postupně měnil a rozšiřoval na průmyslové muzeum. Orientalistické sbírky, které vznikaly z darů přinášených cestovateli, jež podporoval, byly zpočátku chápány spíše jen jako pozoruhodný doplněk. Národopisným muzeem, po Náprstkovi pojmenovaným, se tato instituce stala až po jeho smrti.
