Vědci chtějí poznatky využít při vývoji neinvazivních metod, které by včas odhalily rakovinu tlustého střeva a konečníku. Cílem výzkumu je vyvinout nástroj pro včasný záchyt onemocnění v běžné populaci. Rychlý diagnostický test ze stolice by se jednou mohl stát alternativou ke kolonoskopii.
Výzkumníci v čele s Nicolou Segatou identifikovali přibližně 12 bakteriálních druhů, které se pojí s kolorektálním karcinomem. Tyto specifické bakteriální složky dosahují přibližně 90 procent úspěšnosti při detekci nemoci. "Naše práce ukazuje, že můžeme využít složení střevního mikrobiomu jako přesný a neinvazivní screeningový nástroj pro kolorektální karcinom," uvedl hlavní autor studie.
Projekt zahrnoval 1600 nově sekvenovaných vzorků ze šesti mezinárodních kohort, včetně dvou českých - COLOBIOME a IIGM-CZ. Ty přispěly 328 novými vzorky, z nichž 260 bylo případů rakoviny. Sehrály tak zásadní roli při vývoji a validaci prediktivních modelů, představovaly totiž největší národní podíl v nových datech studie.
Studie, kterou nedávno zveřejnil prestižní časopis Nature Medicine, je založena na strojovém učení. "Tato technologie propojená s metagenomickými analytickými přístupy, které používáme v naší laboratoři," vysvětluje Nicola Segata, "umožňuje vytvoření prediktivního modelu, který určí, zda má daný jedinec vysokou pravděpodobnost výskytu kolorektálního karcinomu."
Souvislost mezi mikrobiomem a vznikem rakoviny tlustého střeva a konečníku byla poprvé naznačena už před několika lety.
Některé konkrétní bakterie totiž mohou narušovat buněčné procesy v těle a podílet se tak na rozvoji nádorů. Kolorektální karcinom je v současnosti třetím nejčastějším zhoubným onemocněním a druhou nejčastější příčinou úmrtí na rakovinu na světě. Až u 60 procent pacientů je přitom nemoc diagnostikována v pokročilém stádiu po vzniku metastáz.
